蓮主要生長期在春夏季，高溫多濕的氣候條件下，危害葉片的小黃薊馬、斜紋夜蛾及毒蛾類皆可能對於蓮田造成嚴重損害。為確保蓮子之收成，臺南區農業改良場籲請農友提早進行病蟲害防治。
　　小黃薊馬蟲體細小，喜歡躲藏在縫隙間，蓮葉在未展開前，最適宜其躲藏及危害，常造成展開之新葉皺縮。當薊馬密度高時，會造成葉片褐化、捲曲，蓮蓬也會受害，影響蓮子的產量及品質。因此應注意田間蓮葉是否有薊馬活動或發生皺縮情形，及時施藥防治，以控制薊馬密度，防止其大量發生危害蓮蓬，避免嚴重損失。防治時以動力噴霧器進行藥劑噴灑，露水乾後將藥液噴至葉背及葉柄等害蟲棲息處，避免直接噴施於蓮子，每隔7天施藥一次，可確保防治效果。葉上如發現有斜紋夜盜蟲或毒蛾啃食時，可同時防治，或另以蘇力菌防治。藥劑防治請參考植物保護資訊系統(https://otserv2.tactri.gov.tw/ppm/)，或臺南區農業改良場網站「農作物登記用藥」( https://www.tndais.gov.tw/ws.php?id=382)。
　　除防治薊馬、斜紋夜蛾及毒蛾類外，同時可將藥劑加入先配好的1:1亞磷酸+氫氧化鉀中和液，將中和液當成水來稀釋殺蟲劑使用，以增加植株對水生真菌類的抗病力。由於亞磷酸為強酸、氫氧化鉀為強鹼，配製時須先秤好相等重量，分別先溶於水中，再混合使用。或者先溶解亞磷酸後、再溶解氫氧化鉀。切不可將兩者同時加入水中，或將兩者混合，再加水稀釋。使用方法為葉面噴佈800倍稀釋液(100公升水中加入125g亞磷酸與125g氫氧化鉀，即為800倍稀釋液)，每週施用1次，連續3次後隔1個月再施用3次，調配當日使用效果較好。亞磷酸+氫氧化鉀中和液被植物吸收後，可誘導健康植株的系統性抗病，主要目的為預防，無治療效果。